Não é um erro. O painel tem um cache de aplicativos, mas não mostra novos de imediato.
Tente abrir, fechar e abrir o painel novamente. Isso tem funcionado para mim. Um logout também funcionará, mas acho que é um pouco exagerado.
Abrir o traço pela primeira vez começará a atualizar seu cache, mas não mostrará a atualização enquanto ela estiver aberta. Assim, o fechamento e a reabertura terão seu cache de aplicativos atualizado.
Observe que seus programas precisam ter um arquivo .desktop em algum lugar nas muitas variações de pastas "aplicativos". Se não houver um arquivo .desktop associado ao programa, ele nunca será exibido no painel.