Eu tive o mesmo problema e encontrei uma solução alternativa.
Clique com o botão direito do mouse no painel do relógio (ou acesse as preferências do painel) e defina a configuração desejada, mas NÃO feche a janela de propriedades. Em vez disso, ao deixá-lo aberto, efetue logout e login novamente. O relógio deve reaparecer com as preferências definidas. Por algum motivo, fechar a janela de propriedades parece redefinir as configurações para campos personalizados em branco, o que faz com que o relógio desapareça.