O que é melhor realmente depende das suas necessidades.
Muitas pessoas usam dual-boot, para que possam usar o mesmo computador com dois sistemas operacionais diferentes, como Ubuntu e Windows ou OS / X.
Nesse caso, 250 gb cada é uma configuração inicial razoável. Se estiver usando o Windows, carregue-o primeiro e depois faça o Ubuntu particionar o disco. Esteja preparado para experimentar um pouco.
Se você quiser apenas usar o computador para o Ubuntu, use o disco inteiro. Você ainda pode usar outro sistema operacional dentro de uma VM, como o VirtualBox.