Está confirmado que o bug existe no Debian também .
Como escrevi no comentário do Launchpad 18 no bug 1742894 .
Eu fiz o downgrade dos seguintes pacotes:
libegl1-mesa_11.2.0-1ubuntu2_amd64.deb
libgbm1_11.2.0-1ubuntu2_amd64.deb
libgl1-mesa-dri_11.2.0-1ubuntu2_amd64.deb
libgl1-mesa-dri_11.2.0-1ubuntu2_i386.deb
libgl1-mesa-glx_11.2.0-1ubuntu2_amd64.deb
libgl1-mesa-glx_11.2.0-1ubuntu2_i386.deb
libglapi-mesa_11.2.0-1ubuntu2_amd64.deb
libglapi-mesa_11.2.0-1ubuntu2_i386.deb
libgles2-mesa_11.2.0-1ubuntu2_amd64.deb
libosmesa6_11.2.0-1ubuntu2_amd64.deb
libosmesa6_11.2.0-1ubuntu2_i386.deb
libwayland-egl1-mesa_11.2.0-1ubuntu2_amd64.deb
mesa-va-drivers_11.2.0-1ubuntu2_amd64.deb
mesa-vdpau-drivers_11.2.0-1ubuntu2_amd64.deb
manualmente com dpkg -i
.
e fixou-os:
cat <<EOF | sudo tee /etc/apt/preferences.d/pin-mesa
Package: libegl1-mesa:amd64
Pin: version 11.2.0-1ubuntu2
Pin-Priority: 1337
Package: libgbm1:amd64
Pin: version 11.2.0-1ubuntu2
Pin-Priority: 1337
Package: libgl1-mesa-dri:amd64
Pin: version 11.2.0-1ubuntu2
Pin-Priority: 1337
Package: libgl1-mesa-dri:i386
Pin: version 11.2.0-1ubuntu2
Pin-Priority: 1337
Package: libgl1-mesa-glx:amd64
Pin: version 11.2.0-1ubuntu2
Pin-Priority: 1337
Package: libgl1-mesa-glx:i386
Pin: version 11.2.0-1ubuntu2
Pin-Priority: 1337
Package: libglapi-mesa:amd64
Pin: version 11.2.0-1ubuntu2
Pin-Priority: 1337
Package: libglapi-mesa:i386
Pin: version 11.2.0-1ubuntu2
Pin-Priority: 1337
Package: libgles2-mesa:amd64
Pin: version 11.2.0-1ubuntu2
Pin-Priority: 1337
Package: libosmesa6:amd64
Pin: version 11.2.0-1ubuntu2
Pin-Priority: 1337
Package: libosmesa6:i386
Pin: version 11.2.0-1ubuntu2
Pin-Priority: 1337
Package: libwayland-egl1-mesa
Pin: version 11.2.0-1ubuntu2
Pin-Priority: 1337
Package: mesa-va-drivers
Pin: version 11.2.0-1ubuntu2
Pin-Priority: 1337
Package: mesa-vdpau-drivers
Pin: version 11.2.0-1ubuntu2
Pin-Priority: 1337
EOF
É uma correção temporária, que funciona para mim.
Atualização de 2018-03-06: o bug 1742894 está corrigido. Agora, o Scilab inicia normalmente no Xenial com AMD APU / GPU. Eu removi o arquivo pin do meu sistema.