Não sei se consigo entender a pergunta corretamente, mas se você quiser executar ferramentas de linha de comando a partir do traço, pressione alt + F2 em vez de pressionar o botão super key (tecla windows) mas você deve substituir coisas como sudo com gksudo, pois ele não abrirá no terminal
uma solução melhor seria escrever comandos de terminal no próprio terminal apenas ctrl + alt + T para abrir o terminal, em seguida, use os comandos que você precisa