É conhecido o bug do Wayland (eu o li como "alta segurança é melhor que o conforto do usuário" e eu não suporte a lógica do desenvolvedor).
Já foi relatado (veja bug 1652282 ).
Outras aplicações de raiz também estão quebradas no Wayland (veja o bug 1713313 e bug 1713311
).
Você deve mudar para a sessão "Ubuntu on Xorg" para esses aplicativos.
Para aplicações que usam su-to-root e pkexec você pode querer adicionar este código a /etc/xdg/autostart/xhost.desktop
(veja meu comentário no launchpad por sua conta e risco com o comando abaixo:
cat <<EOF | sudo tee /etc/xdg/autostart/xhost.desktop
[Desktop Entry]
Name=xhost
Comment=Fix graphical root applications
Exec="xhost +si:localuser:root"
Terminal=false
Type=Application
EOF
Se você não quer uma solução permanente, você pode usar o método @ ravery:
apenas digite
xhost +si:localuser:root
no terminal antes de iniciar o gparted