Obtenha valores exclusivos e suas contagens em uma coluna

Question

Eu tenho uma coluna como esta.

Streptococcus
Ecoli
Bcoli
Ecoli
streptococcus
Streptococcus
Mycobacterium
Ecoli

Eu quero um arquivo como este (que inclui todos os valores exclusivos e suas contagens correspondentes)

Streptococcus 3
Ecoli 3
Bcoli 1
Mycobacterium 1

Alguém por favor pode ajudar a consegui-lo no Ubuntu 12.04?

    

Answer 1

Usando classificação e uniq,

$ sort f | uniq -ci | awk '{print ,}'
Bcoli 1
Ecoli 3
Mycobacterium 1
streptococcus 3

    

Answer 2

Supondo que cada item apareça em outra linha, aqui está uma solução python. Claro que você pode escrever o resultado em um arquivo em vez de imprimi-lo.

#!/usr/bin/env python
sourcefile = "/path/to/sourcefile"

with open(sourcefile, "r") as germ:
    germ = [item.lower().replace("\n", "") for item in germ.readlines()]
for item in sorted(set(germ)):
    print item.title(), germ.count(item)

dá:

Bcoli 1
Ecoli 3
Mycobacterium 1
Streptococcus 3

Para usá-lo

cole o código acima em um arquivo de texto vazio, salve-o como get_uniques.py , torne-o executável (por conveniência, para que você não precise digitar o idioma se o executar) e execute-o em uma janela de terminal o comando:

/path/to/get_uniques.py

Caso você queira gravá-lo em um arquivo diretamente

Use o código abaixo:

#!/usr/bin/env python
sourcefile = "/path/to/sourcefile"
destfile = "/path/to/destinationfile"

with open(sourcefile, "r") as germ:
    germ = [item.lower().replace("\n", "") for item in  germ.readlines()]
with open(destfile, "wt") as germcount:
    for item in sorted(set(germ)):
        germcount.write(item.title()+" "+str(germ.count(item))+"\n")