Você pode usar o seguinte código para essa finalidade,
#!/bin/bash
dir=/path/to/folder
j=1
for i in $dir/*
do
mv "$i" "$dir/$j"
let j=j+1
done
Salve como digamos batch_rename.sh
, dê permissão de execução como,
chmod +x /path/to/batch_rename.sh
execute como
./batch_rename.sh