Se você não se preocupa em usar o espaço Samsung SSD, coloque tudo lá, pois é a melhor escolha, embora colocar partição / boot no Sandisk SSD possa economizar espaço no Samsung SSD e isso não afetará muito o seu sistema, a única coisa que mudaria seria um tempo de inicialização aumentado em cerca de 5 ou 10 segundos.