Colocar uma linha como
Acquire::http::Proxy "http://proxy-address:8000/";
em um novo arquivo, por exemplo, /etc/apt/apt.conf.d/10-proxy
deve fazer o truque. Certifique-se de ter configurado espelhos HTTP no seu sources.list
se desejar se conectar a um proxy HTTP ou apenas adicionar outra linha Acquire::ftp::Proxy
para o espelho / proxy FTP. Altere também o endereço e o número da porta de acordo.