A questão gráfica de lado, seu principal problema é o superaquecimento.
Como funciona no Windows, mas não no Ubuntu, significa que o seu Laptop está usando a CPU para que ela faça alguma coisa. Declaração óbvia, mas o número de processos "desonestos" que as pessoas têm em seus computadores pode causar esse problema. O fato de que o ventilador está constantemente funcionando e você ainda tem problemas de aquecimento significa que há um processo desonesto.
Veja utilitários simples como top
para ver o que está usando seus ciclos de CPU.
Use o comando services
para determinar se você não instalou serviços como MYSQL ou Apache dos quais não precisa.
O brilho está definido como alto? (contribuinte indireto de calor)
Existem drives USB conectados que não são autoalimentados?
Ou a ventoinha está rodando a uma taxa menor que a do Windows, então o ventilador não está fazendo o trabalho necessário para resfriar a CPU. (Existem utilitários de fãs que permitem ver a rapidez com que o ventilador está girando nos dois sistemas O / S)
O Windows tende a ter um melhor controle do ventilador e é por isso que sugeri o último item.
Execute o driver de vídeo mais básico. Se você instalou um, ele tem os sinos e assobios 3D para removê-lo para ver se isso ajuda.
É tudo o que posso pensar no momento, boa sorte!