O pacote Samba (mesmo no Ubuntu 13.04) aponta para o Samba versão 3 (especificamente 3.6 em 12.04), então um usuário que queira instalar o Samba instalaria a versão 3 do software (assim como qualquer software que dependesse do Samba) .
O pacote samba4 está disponível no Ubuntu desde o 10.04 (versões mais antigas não são mais suportadas, então uma busca de pacotes não mostra resultados delas). Por várias razões, os pacotes não são removidos dos repositórios (há casos em que isso acontece, geralmente quando o pacote deixa de existir), e certamente não seriam removidos para uma versão LTS, apenas para serem lidos posteriormente.
Além disso, para instalar o Samba versão 4, um usuário teria que procurar e instalar especificamente o pacote samba4.
Por fim, o samba4 (mesmo em 13.04) está no repositório Universe e, como tal, não é suportado pela Canonical. Então, do ponto de vista de negócios, o Samba 4 estando disponível em 12.04 é irrelevante.
De link
Universo - Software mantido pela comunidade, ou seja, não oficialmente software suportado.