Para ocultar o banshee do menu no KDE, você precisará alterar o arquivo da área de trabalho para mostrar apenas o item de menu no Unity / Gnome
mkdir -p ~/.local/share/applications
cp /usr/share/applications/banshee.desktop ~/.local/share/applications
Edite o arquivo ~/.local/share/applications/banshee.desktop
Adicione ao final deste arquivo
OnlyShowIn=GNOME;Unity;
Salvar.
No entanto, o acima apenas oculta o banshee. Para evitar que o banshee seja iniciado no KDE, você precisará editar o script executável do banshee
sudo nano /usr/bin/banshee
adicione agora o seguinte na posição mostrada:
if [ x"$KDE_FULL_SESSION" = x"true" ]; then
exit
fi