Não vejo razão para você não conseguir fazer o boot duplo. Outra opção poderia ser rodar o FreeNAS no Ubuntu com Virtualization, então você não precisaria reinicializar apenas para tentar o FreeNAS
Aqui está um tutorial sobre como executar o FreeNAS no VirtualBox (espero que ajude)
Se você preferir, aqui está um tutorial sobre dual boot no Ubuntu e no FreeBSD, deve funcionar com o FreeNAS