Se o seu arquivo monitores.xml estiver configurado da maneira que você deseja que seus monitores estejam após o login, tente isto e reinicialize. Observe que, por padrão, não há arquivo monitores.xml existente em /var/lib/gdm3/.config (pelo menos ele não estava lá para minha configuração).
sudo cp ~/.config/monitors.xml /var/lib/gdm3/.config