Você pode, talvez, indexar os arquivos em uma unidade diferente usando tracker-gui .
Instale-o usando o seguinte comando:
sudo apt-get install tracker-gui
Após instalá-lo, abra-o e vá para a guia Locais . Clique no botão + e adicione a unidade ou diretório específico que você deseja indexar.
Não é preciso dizer que a unidade deve ser montada para poder ser indexada.