Eu costumo seguir o princípio de manter apenas partições do Windows à esquerda, partições comuns no meio e apenas partições do Ubuntu (viz boot, swap, tmp, var, etc) na extrema direita. Isso significa que as partições não são misturadas e são fáceis de recuperar em caso de falha. Por isso, pelo meu raciocínio, eu sugeriria a partição de dados D: à esquerda do Ubuntu.