Eu executei o Dualboot Ubuntu com o Windows por um longo tempo e isso começou a acontecer comigo desde que eu instalei qualquer variação de 17.04 xBuntu.
Toda vez que eu inicializo no Windows, na próxima vez que eu tento inicializar no x / l / gnome / ubuntu, eu tenho o initramfs e só tenho sucesso se executado:
e2fsck -v -f -y -C 0 /dev/sdaX (ubuntu 17.04 installation partition)
O estranho é que eu tenho outras instalações do linux, como o Ubuntu 14.04 e o Fedora 25, em outras partições e isso só ocorre na instalação do 17.04.
Estou usando a partição EFI, que compartilhou a partição efi de inicialização para toda a instalação. É muito estranho para mim isso e eu não sei mais o que fazer.
Se você tem um driver do Windows (como ext2fs) instalado que permite montar / ler / gravar em partições Ubuntu EXT4, então é isso que provavelmente está corrompendo sua instalação do Ubuntu. Desinstale este driver.
Se você deseja compartilhar arquivos entre o Windows e o Ubuntu, a melhor maneira é criar uma nova partição NTFS no disco rígido. Tanto o Windows quanto o Ubuntu podem montar / ler / gravar isso sem causar problemas.