Agora que você excluiu as contas de usuário, nem deluser
nem userdel
saberá nada sobre elas ou seus diretórios iniciais, pois as entradas /etc/passwd
correspondentes desapareceram. Basta excluir manualmente os diretórios depois de fazer o backup de todos os dados importantes:
sudo rm -r /home/user1 /home/user2 ...
Você poderia, é claro, ter excluído os diretórios ao excluir o usuário como as outras respostas sugeridas.