Você pode tentar instalar o Lubuntu a partir de um arquivo iso alternativo
Os arquivos iso alternativos do Lubuntu usam o instalador Debian no modo texto. Existem dois casos de teste para isotestes, e eu sugiro que você use este,
Instalação alternativa (encriptação) no Lubuntu Alternativa i386 no Yakkety Daily
Eu acho que você pode selecionar as opções corretas com a ajuda das instruções do testcase que contém 'LVM criptografado' e 'home criptografado'. Você provavelmente precisará apenas de um deles, mas o testcase testa ambos.
O mesmo procedimento funciona para as duas versões do Lubuntu: 32 bits e 64 bits.
Alternativas para o arquivo iso alternativo
Eu não recomendo instalar o Ubuntu, remover o Unity e instalar o LXDE. É difícil "remover o suficiente, mas não demais".
É possível iniciar a partir do arquivo iso do Ubuntu mini.iso ou Ubuntu Server e instalar o LXDE. Esta é uma boa opção, se você quiser um sistema personalizado com apenas os pacotes de programas que você precisa. Eu fiz isso recentemente, mas é mais difícil do que instalar o Lubuntu a partir de um arquivo iso alternativo.