As aplicações gráficas não devem ser lançadas usando o sudo. Esta é a causa do primeiro aviso. Não tenho certeza por que você precisaria lançar o virtualbox usando o sudo, mas se você usar o gksudo:
gksudo virtualbox
Uma busca no segundo aviso sugere que não é nada para se preocupar. Aparentemente, significa que um ou mais dos arquivos PNG usados tem um perfil sRGB antigo. Tudo ainda deve funcionar corretamente.