Eu temporariamente consertei isso adicionando o comando à lista de aplicativos de inicialização:
bash -c "sleep 2 && initctl restart unity-panel-service"
Você também pode pressionar ALT + F2 e executar:
initctl restart unity-panel-service
Ps: Isso reiniciará todos os serviços de indicadores e alguns deles desaparecerão se eles começarem antes.