Eu suponho que você tenha o Ubuntu 64bit instalado!
Vá para a pasta:
cd cpdf-binaries-master/Linux-Intel-64bit
Agora, inicie o comando:
./cpdf --help
Se você quiser que o comando esteja disponível em todos os lugares no sistema:
sudo cp cpdf /usr/local/bin/
ou o que eu faço
cp cpdf ~/bin/