A duplicidade agora suporta isso (na versão v0.7.11 e acima) por meio da opção --copy-links
. Veja a página man de duplicidade .
Note que esta é uma versão posterior de duplicidade do que pacotes padrão xenial ou confiáveis do Ubuntu. Você precisa instalar a duplicidade de upstream, por exemplo. ppa:duplicity-team/ppa