Você precisa instalar o ccsm.
sudo apt-get install compizconfig-settings-manager
sudo apt-get install compiz-plugins
Abra o compizconfig-settings-manager com alt-F2, digite ccsm.
Desça até "Ubuntu Unity Plugin". Escolha a aba "Switcher". Desabilite as ligações de teclas alt e shift-alt-tab. ("Key to start the switcher" e "Key para mudar para a janela anterior no Switcher". Clique no botão "Voltar".
Desça até a seção "Gerenciamento de janelas". Aqui você pode selecionar outro switcher. Ativar o "Switcher de aplicativo estático", resolver quaisquer conflitos potenciais, definindo a configuração de "Switcher de aplicativo estático". Agora você pode ajustar o switcher clicando nele. Eu mudei alt-tab e shift-alt-tab para "Próxima janela (Todas as janelas)" e "Janela anterior (Todas as janelas)".
Experimente encontrar as configurações que funcionam melhor para você. Se você quiser voltar às configurações do poriginal, simplesmente desabilite o Static Application Switcher e ative as combinações de teclas em "Ubuntu Unity Plugin" novamente.