Seu problema pode ser o cabo HDMI. Eu tenho uma configuração semelhante (ASUS NX500 executando o Ubuntu 15.10 com NVIDIA 352.41, e meu monitor externo é um ASUS PB287Q (igual ao seu)). A única diferença é que estou executando o monitor externo a partir da porta de exibição e obtenho excelente desempenho do monitor externo. Quando eu comprei pela primeira vez o ASUS PB287Q e conectei-o usando HDMI tive grandes problemas de atraso (30 fps externos), mas que estava sob o Windows 8.1 ... eu mudei para a porta de exibição e ele fixo no Windows. Quando atualizei para o Ubuntu 15.10 do Windows, nunca tive problemas com o desempenho do monitor externo.