Esta é uma questão de uso de recursos que gera o calor. Como mencionado nos comentários, o PhpStorm usa muitos recursos e uso da CPU. Isso, por sua vez, significa que sua CPU precisa executar e gerar calor (como subproduto) para processar os requisitos. Esse é um efeito colateral de programas intensos em recursos e, infelizmente, não há boas soluções para esse problema. (O Windows também é atormentado pelo mesmo problema)
Além de limitar manualmente a potência da sua CPU (o que poderia afetar o desempenho geral do sistema e talvez fazer com que o PhpStorm não funcione), não há uma maneira real de superar esse problema.