Se a unidade que deseja formatar também for a unidade que você está usando, não será possível alterar o formato. A maneira mais fácil é usar um disco de Inicialização ao Vivo e inicializar dentro da área de Teste (onde você tem a opção de instalar o Ubuntu na área de trabalho). A partir daí, você pode formatar a unidade, mas esteja ciente de que a formatação apagará os dados da unidade.