Se você está procurando a pasta pessoal, pode valer a pena obter a variável HOME
como tal:
import os
self.ind.set_icon_theme_path(os.path.join(os.environ['HOME'], 'directory'))
self.ind.set_icon("the_icon")
caso contrário, se você precisar da localização da pasta do script, poderá usar o seguinte:
import os
self.ind.set_icon_theme_path(os.path.dirname(os.path.realpath(__file__)))
self.ind.set_icon("the_icon")
Referência: Encontre o diretório atual e o diretório do arquivo