Acho que você precisa reinstalar o carregador do grub para exibir o Ubuntu e o Windows na inicialização.
Você pode fazer isso com o software boot-repair, ele instalará o grub no seu sistema, para aquele boot qualquer Ubuntu em mídia removível ou pendrive e inicie-o como "tente Ubuntu" e goto terminal e instale o boot-repair seguindo o comando .
sudo add-apt-repository ppa:yannubuntu/boot-repair && sudo apt-get update
sudo apt-get install -y boot-repair && (sudo boot-repair &)
boot-repair
Em seguida, clique no botão "Reparação recomendada". Quando o reparo estiver concluído, observe a URL (paste.ubuntu.com/XXXXX) que apareceu em um papel, depois reinicie e verifique se você recuperou o acesso aos seus sistemas operacionais.
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