Como você pode acessar um terminal, se você tiver acesso à Internet, você pode tentar instalar o desktop do Ubuntu:
sudo apt-get install ubuntu-desktop
Isso deve instalar todos os aplicativos padrão presentes em uma nova instalação. Se isso não funcionar, você pode usar dpkg
para obter a lista do software instalado e obter a mesma lista em um LiveCD e instalar todos os pacotes ausentes manualmente. Para obter a lista, use:
dpkg --get-selections > package_list.txt
Antes de tentar qualquer coisa, se você tiver dados importantes, lembre-se de usar um LiveCD e faça um backup !!!