Acabei de ter o mesmo problema que você e até criei um relatório de erros no link .
Você pode ver se o culpado é o PulseAudio por não usá-lo e apenas usar o ALSA com arecord
.
Teste arecord test
na CLI, pressione ctrl + c
para parar a gravação. Em seguida, reproduza com aplay test
e veja se o estalo está presente.
Eu apenas fiz isso e mudei meu /etc/modprobe.d/alsa-base.conf
de options snd-hda-intel position_fix=1
para options snd-hda-intel position_fix=2
, reiniciei e fiz o arecord
e agora tenho áudio claro.