Você pode usar a opção Imagem / tamanho da tela no menu para alterar o tamanho da imagem sem alterar os tamanhos da camada. Há uma opção para escolher quais camadas você deseja redimensionar para ajustá-las ao tamanho da nova tela, centralizar as camadas, etc.
Isso pode ser útil para você, estou usando o GIMP 2.8, mas funciona no 2.6 da mesma forma.
Boa sorte!