Tente desligar do terminal.
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Enquanto estiver na GUI da área de trabalho, pressione Ctrl + Alt + F1 (ainda não).
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Faça login com suas credenciais.
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Tipo:
sudo shutdown now
Lá você pode ter uma tela melhor para ver o que está acontecendo, quando o processo de desligamento começa, normalmente pode ser um "serviço / daemon" ou um motorista demorando mais tempo para ser morto