Existem várias ferramentas que podem exibir graficamente seu uso de disco, por exemplo, filelight . Sem mais investigação, é quase impossível dizer o que faz com que seu disco fique cheio. Se você obtiver essas informações adicionais, deverá postar isso em sua pergunta para obter respostas mais precisas.
Para mim, os pacotes baixados (arquivos .deb) são muitas vezes uma fonte de alto uso de disco e você pode limpar isso usando o comando apt-get clean
.
E, como as outras respostas afirmam, não consigo entender por que seu disco não deve ser montado corretamente.