A diferença é que a atualização de 11,10 deixará suas configurações anteriores intactas e poderá levar a problemas com configurações que não podem ser simplesmente transferidas de uma versão para outra, mas esses problemas geralmente são menores.
O que também pode acontecer neste caso é que você obtém muitos pacotes obsoletos, e às vezes pode ter problemas com a atualização de certos pacotes, especialmente se você tiver instalado aplicativos de terceira parte.
A atualização de uma versão beta para a versão final geralmente não gerará esses problemas e será muito mais fácil.