Eu tenho o mesmo problema e estou google'ing há algum tempo, é o que eu venho até agora: Este site indica que os computadores recentes, especialmente os mais recentes que 2010, usam o sistema de inicialização da UEFI, e não o MRB. Esta pode ser a causa do problema; Como diz aqui que o wubi usa o MRB para inicializar o Ubuntu (se isso for verdade). Pode valer a pena um tiro