Essa é a maneira como a virtualização funciona. Quando você define sua máquina virtual, você define o que é e quais dados ela pode ver. Quando você executa essa máquina, ela não pode fazer nada além do que você definiu.
Essa é uma razão pela qual a virtualização é frequentemente usada para testes ou "sandboxing" - ela pode controlar erros de programas inocentes e mal-intencionados da destruição de dados importantes.
Acredito que é possível definir recursos de disco adicionais para o vmplayer, definindo e usando arquivos .vmx que apontam para o armazenamento de arquivos adicional para a máquina virtual; e que há um assistente para definir esse hardware adicional. Eu não sei sobre a disponibilidade desses recursos.
O Ubuntu também inclui um gerenciador virtual e o qemu-kvm, que podem ser usados para definir máquinas virtuais e o que elas contêm.