Neste caso, eu tentaria criar o diretório para o qual a licença deveria ser gravada. Abra um terminal com Alt-Ctrl-T e digite:
sudo mkdir -p /usr/local/MATLAB/R2012a/licenses
sudo chmod a+rw /usr/local/MATLAB/R2012a/licenses
Os dois primeiros já podem existir e, em caso afirmativo, basta prosseguir. Em seguida, tente a instalação da licença novamente.