Existem 2 maneiras de conseguir isso, em primeiro lugar você pode criar uma apresentação de slides que fará a transição de várias imagens 1 por vez. Veja Como faço para criar um slideshow de papel de parede? sobre como para fazer isso.
No entanto, se meu entendimento estiver correto, você está perguntando como criar um plano de fundo personalizado com várias imagens.
Para fazer isso, você precisa usar um software de edição de imagens (como o GIMP) com recursos de camadas. Neste software você pode construir o seu fundo personalizado como você gosta com várias imagens com a capacidade de colocar, redimensionar, girar, etc Você pode "travar" as camadas e usar a imagem que você cria como plano de fundo da área de trabalho. FYI, o GIMP está disponível no centro de software do Ubuntu e é bastante difícil de usar para um iniciante.