A Canon optou por não fornecer suporte oficial ao Ubuntu, e isso limita o que você pode fazer. Você não pode usá-lo com o gscan2pdf, por exemplo.
Para criar um PDF de um documento digitalizado:
- Analise no GIMP
- Salve a imagem .jpg
- Arraste a imagem .jpg para um novo documento no Libre Office
- Exportar o documento como PDF
Experimente a qualidade da digitalização da imagem, bem como a qualidade de exportação do PDF, para obter um PDF razoavelmente pequeno. Eu costumo digitalizar a 300dpi, em seguida, ajustar a qualidade de exportação de PDF para obter os melhores resultados.