O PPA que você apontou não tem um pacote disponível para Oneiric (11.10) ou posterior.
Isso explica seus erros 404.
Olhando para packages.ubuntu.com , o thinkingrock nunca foi um pacote oficial nos repositórios. Assim você não encontrará no Synaptic.
Olhando em SourceForge , parece haver um grande fontes.zip acessível. Assim, em teoria, você pode baixar, compilar e instalar de acordo com as instruções do wiki .
Noto que agora existe uma empresa que adotou a versão de código aberto e atualizou sua versão para a versão 3 e requer uma chave de licença etc.
Se você gosta de um desafio - use as instruções do wiki para compilar e instalar. Se você quer uma vida fácil ... talvez uma alternativa como wunderlist pode ser mais fácil.