sudo ou gksudo para agir sobre eles como root.
chown user:group para alterar a propriedade.
chmod 'permission in octal' para alterar o tipo de permissão do usuário: grupo: todos para su user para mudar para um usuário apropriado.
Eu freqüentemente coloco coisas em / opt que pertencem a vários usuários, mas são bem portáveis e não estão em repositórios. Eu não acho que dizer 'use sudo' seja necessariamente correto para perguntas específicas '/ opt'.