Você deve ser capaz de simplesmente rsyncar o / var / spool / imap do disco rígido antigo para o novo servidor. Para isso, você não precisa fazer o chroot no disco rígido antigo.
Monte sua unidade antiga no modo somente leitura (por segurança) e use algo assim (supondo que você montou seu disco rígido antigo em / mnt / old-hdd):
rsync -anv / mnt / old-hdd / var / spool / imap / / var / spool / imap /
Se você estiver satisfeito com o que o rsync faria, você poderá executá-lo novamente sem o "-n". FYI, "-n" é o modo "dry-run" do rsync.
Boa sorte