Tente executar o MySQL normal (obtido via Synaptic). Realmente, não há muito benefício em rodar o XAMPP no Ubuntu, quando você pode facilmente instalar os componentes em sua máquina e obter facilmente a funcionalidade igual ou melhorada.
@jgbelacqua fornece um link para um problema com o UTF-8 e sugere a remoção da referência UTF-8. Eu não li o link dele cuidadosamente o suficiente para saber se ele estava sugerindo usar algum outro conjunto de caracteres, mas se é assim, é um mau conselho. O MySQL certamente suporta o UTF-8 e existem muitas boas razões para você usá-lo também. Se a versão do MySQL fornecida com o XAMPP não puder lidar com isso, então o XAMPP é defeituoso e deve ser abandonado.