Você precisará criar uma entrada no arquivo de configuração do fstab. O arquivo de configuração fstab contém instruções para montar automaticamente sistemas de arquivos na inicialização. Você pode incluir compartilhamentos de rede, sticks USB e HDD interno neste arquivo.
Procure aqui um guia completo:
Vale a pena notar que o seu pendrive provavelmente será um dispositivo formatado em fat32 se você não tiver formatado você mesmo em um sistema de arquivos diferente.