Tente executá-lo sem sudo ? Eu tentei executar com sudo e recebi um erro diferente relacionado à permissão, mas executá-lo sem funcionar para mim.
EDITAR:
A resposta acima está errada. De acordo com esse bug , isso acontecerá quando / home for um symlink para um diretório diferente.
Para corrigir isso, você precisa que seu diretório / home seja um diretório real. Você pode executar o seguinte comando para remover o symlink e criar um diretório real em / home.
sudo rm -R /home && sudo mkdir -p /home/${whoami} && sudo chmod ugo+rwx /home/$whoami
Como alternativa, você pode criar um usuário diferente para executar o cloudcompare, caso não deseje modificar seu sistema.