Tanto quanto sei, as únicas opções para o JACK são passadas da linha de comando, quando o daemon é iniciado. O único arquivo de configuração que eu conheço é o ~ / .jackdrc (eu acho que é usado pelo qjackctl) que armazena o comando que é usado para rodar o JACK, com todos os argumentos. Por exemplo, meu ~ / .jackdrc contém:
/usr/bin/jackd -P5 -m -dalsa -dplughw:0 -r44100 -p1024 -n3 -o4
Armazena a configuração completa. Então, se você quiser copiar a configuração do puredyne, dê uma olhada neste arquivo.