Obrigado pela dica sobre o mapeamento errado, Charles Green. Eu havia mapeado ctrl + alt + a para entrar na senha do keepass, o que funcionou, mas parece ter atrapalhado o ctrl + um atalho de alguma forma. Foi salvo como ctrl + ae ('a' e 'e' foram retratados como um símbolo combinado). A remoção do mapeamento keepass restaurou a antiga marca toda a funcionalidade.