A partir dos documentos do VPC, parece que, por padrão, a interface Ethernet e o dhclient não esperam o IPv6 por padrão, portanto, isso precisa ser configurado.
Quando eu inicio uma instância com o IPv6 habilitado ou conecto uma interface de rede (eni) que tem atribuições de IPv6 a uma instância executando o Ubuntu, eu não obtenho os endereços IPv6 configurados. Existem endereços locais de ligação nas interfaces e ":: 1/128" na interface "lo", mostrando que o kernel tem IPv6 compilado. Então, talvez o problema seja com DHCP ou algo semelhante. Eu tenho usado o Ubuntu AMI que está entre as opções ao iniciar instâncias através do console da web. O IPv6 funciona para o Amazon Linux sem nenhuma alteração nesse sistema. Assim que mudei meus esforços de IPv6 para o Amazon Linux, as coisas começaram a funcionar melhor.
Existe um problema real com o Ubuntu AMI e o IPv6? Alguém sabe uma maneira de fazer o IPv6 funcionar no Ubuntu no AWS EC2?
A partir dos documentos do VPC, parece que, por padrão, a interface Ethernet e o dhclient não esperam o IPv6 por padrão, portanto, isso precisa ser configurado.